La OMCT ofrece una asistencia médica prioritaria en los países donde se han cometido actos de tortura, en cooperación con las organizaciones locales de la Red SOS-Tortura y los centros de rehabilitación de las víctimas. En efecto, es más eficaz, en términos de tiempo y de dinero, curar las víctimas en su propio país, si las condiciones lo permiten, o en un Estado vecino, antes que transferirlos a un país occidental. En algunas ocasiones, el estado de salud de la víctima exige su traslado a un país desarrollado. En estos casos, la decisión es tomada con base en un certificado médico, en coordinación con la ONG miembro de la Red SOS-Tortura, que haya depositado o transmitido la solicitud de asistencia.
Entre las diversas formas de asistencia médica ofrecidas por la OMCT, debemos citar :